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Il comitato giapponese per l'IUCN (IUCN-J) è stato istituito nel 1980, quando in Giappone è stata lanciata la Strategia per la conservazione mondiale, allo scopo di scambiare informazioni sull'IUCN e facilitare la cooperazione tra i membri dell'IUCN in Giappone. Alcuni dei principali lavori condotti dal Comitato giapponese sono il lancio dell'incontro dei membri regionali dell'IUCN nel nord-est asiatico nel 1995 e il simposio internazionale chiamato "Fontainebleau a Kyoto－Patrimonio mondiale e tradizione giapponese" che ricorda il 50° anniversario dell'IUCN nel 1998. In Inoltre, le organizzazioni associate legate all'area protetta hanno istituito il Comitato giapponese per la Commissione mondiale sulle aree di protezione dell'Asia orientale (WCPA-EA-J) e hanno tenuto la seconda conferenza sulle aree protette dell'Asia orientale a Kushiro nel 1996. Il Comitato è stato ufficialmente riconosciuto come un comitato nazionale dal Consiglio IUCN nell'ottobre 2001. Ad aprile 2010, il comitato comprende circa 20 organizzazioni membri tra cui il Ministero degli Affari Esteri e il Ministero dell'Ambiente. È presieduto da Tsunao Watanabe, Japan Wildlife Research Centre, United Nations University. L'ufficio si trova presso la Nature Conservation Society of Japan.